Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCAPQ12770 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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