Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms