Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms