Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms