Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms