Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MANFP55145 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MANFP55145 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MANFP55145 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms