Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIRAP54198 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms