Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMK1P53667 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMK1P53667 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LIMK1P53667 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms