Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms