Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms