Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms