Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPB2P35606 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPB2P35606 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms