Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms