Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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