Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms