Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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