Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPAP23025 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XPAP23025 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XPAP23025 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms