Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms