Protein–RNA interactions for Protein: P20231

TPSB2, Tryptase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPSB2P20231 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPSB2P20231 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms