Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN1P18031 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms