Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms