Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms