Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GLI3P10071 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GLI3P10071 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GLI3P10071 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms