Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms