Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POP4O95707 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POP4O95707 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POP4O95707 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms