Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms