Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA2O43364 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms