Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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