Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms