Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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