Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms