Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms