Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms