Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms