Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms