Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG4Q9H9E3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms