Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms