Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM15Q9C019 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms