Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms