Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms