Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms