Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL25A1Q9BXS0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms