Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms