Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms