Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS2Q99743 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS2Q99743 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS2Q99743 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms