Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms