Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NELL2Q99435 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms