Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC22A12Q96S37 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC22A12Q96S37 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms