Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms