Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms